土台东部已发现31座新石器时代“良渚文化”的墓葬，出土大量玉器，有琮、壁、璜、斧、钺、环等，都是礼器、祭器和饰物，制作精美，工艺水平甚高，还有石器、陶器等生产和生活用具，有的墓中有双手反缚状的陪葬者的骨骼，说明这里是一处部落首领的墓地。北部有距今5000年左右的“崧泽文化”墓葬18座，叠在上面的有战国墓4座、西汉墓96座。

　　福泉山古文化遗址地下的灰黑土层以下，是三层灰黄。在灰色和黄褐色土中发现良渚墓葬18座，墓内陪葬物制作精细，为新石器时代罕见的珍品。黄褐土层下是黑褐土层，发现17座崧泽晚期墓葬，其中有同性合葬和男女合葬，在太湖地区属首次发现。黑褐土层下又是灰黑土层，属崧泽文化早期古人的居住地遗址，反映了五六千年前上海先民的生活面貌。遗址一层层土色变化，反映了马家浜、崧泽、良诸文化早晚有序的文化层叠压关系，可看作是一份距今60OO年至 2000年的上海远古时代的历史年表。该古文化遗址被誉为上海的“金字塔”。